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星期六, 2017年8月19日
 
  
媒体关注报道我校在菠菜栽培种基因组研究取得新进展

发布日期: 2017/6/13  作者: 新闻中心   浏览次数: 2175   返回


         近日,生命与环境科学学院植物种质资源开发中心王全华研究员课题组和美国康奈尔大学费章君教授课题组联合报道了一个新的菠菜栽培种基因组草图,同时对120份野生和栽培菠菜进行了转录组变异等分析,在菠菜基因组结构和进化、抗病性、园艺特性和菠菜遗传多样性、进化与驯化方面提出了新的见解。论文“Draft genome of spinach and transcriptome diversity of 120 Spinacia accessions” 发表在5月24日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。


         该项研究发现引起了媒体的关注,近日,《新民晚报》、中青在线等媒体相继对此进行了采访报道。相关报道如下:

来源:新民晚报 2017年6月2日 8版 上海新闻 版面头条
标题:上师大研发改良菠菜今秋试种 少了苦涩口感 多了营养价值
记者:王蔚
图说:有些孩子对菠菜的些许苦涩味颇为反感 来源:网络
  
        在各种蔬菜中,菠菜因叶绿素含量最高,又被称为“保健蔬菜”,是市民餐桌的常选菜品。今天上海师范大学报告称,由该校科研人员研发的改良菠菜即将投入试种,这种菠菜更营养且口感更佳。

        上师大生命与环境科学学院植物种质资源开发中心教授王全华课题组和美国康奈尔大学教授费章君课题组,经过多年研究,于近日联合报道了一个新的菠菜栽培种基因组草图,同时对120份野生和栽培菠菜进行了转录组变异等分析,在菠菜基因组结构和进化、抗病性、园艺特性和菠菜遗传多样性、进化与驯化方面提出了新的见解。相关论文发表在今年5月最新一期的《自然通讯》杂志上。王全华说,人们喜食菠菜,但也有些人特别是孩子,对菠菜的些许苦涩味颇为反感,这也是研究小组试图着力进行品种改良的突破点之一。

        研究小组对菠菜进行了全基因组测序及分析,通过对转录组变异分析发现,与番茄、黄瓜等其他蔬菜作物不同,栽培菠菜品种的遗传多样性与它们的野生祖先没有太大差异,这说明菠菜的驯化经历了较弱的瓶颈效应,同时也意味着菠菜的遗传改良还有很大的空间。王全华说,古今菠菜在品质、营养和口感上几乎没有多大差异。“这项全面的基因组和转录组分析数据,将为促进菠菜研究和育种改良提供重要资源,可用于培育抗病性更强、产量更高、品质更好的菠菜品种。现在的菠菜种植约20天一茬,如果长期在一块田里播种,十分容易得病。因此,通过采集和研究菠菜全基因组信息,未来将选用硝酸盐、草酸含量相对较低些,维C含量更高些的改良品种,吃口更爽。上师大推出的改良菠菜已获本市农业部门的种子认定,今秋将投入试种。

链接地址:http://shanghai.xinmin.cn/msrx/2017/06/02/31073605.html

来源:中青在线 2017年6月2日
标题:上海师大与康奈尔大学两校教授联合发布菠菜栽培种基因组草图
记者:周凯

        中青在线讯(中国青年报·中青在线记者 周凯)近日,上海师范大学生命与环境科学学院植物种质资源开发中心王全华研究员课题组和美国康奈尔大学费章君教授课题组联合发布了一个新的菠菜栽培种基因组草图,同时对120份野生和栽培菠菜进行了转录组变异等分析,在菠菜基因组结构和进化、抗病性、园艺特性和菠菜遗传多样性、进化与驯化方面提出了新的见解。

        论文“Draft genome of spinach and transcriptome diversity of 120 Spinacia accessions” 发表在5月24日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。

        菠菜是重要的叶用蔬菜,含有丰富的类胡萝卜素、叶酸和维生素C等营养物质。菠菜原产于亚洲中部,现已在全球广泛种植,据报道,2014的年产量为2430万吨,我国菠菜产量占世界总产量的89%,是世界上最大的菠菜种植和消费国家。近年来,国内外菠菜的基因组学研究取得一定进展,但关于栽培菠菜的进化、驯化,以及菠菜基因组结构和进化等资料有限。

        研究小组对一个菠菜自交系材料进行了全基因组测序及分析,并对广泛收集的120份野生和栽培菠菜进行了转录组测序。分析结果显示,菠菜基因组全长1009 Mb,富含重复序列,编码25495个基因。研究小组通过对转录组变异分析发现,与其他蔬菜作物(如番茄和黄瓜)不同,栽培菠菜品种的遗传多样性与它们的野生祖先没有太大差异,说明菠菜的驯化经历了较弱的瓶颈效应。这意味着菠菜的遗传改良还有很大的空间,而同时也给利用更精确的基因组标记来加快育种进程增加了困难。

        尽管如此,研究小组在菠菜全基因组范围内确定了93个在驯化过程中发生的选择性清除,其中包含许多已知的QTLs和标记,如抽薹、开花,叶片数等人们所公认的驯化性状。此外,在野生和栽培菠菜间一组高度发散的基因组区域中也包含与菠菜重要性状相关的QTLs和标记。

        这项全面的基因组和转录组分析,在菠菜抗病性、园艺特性和菠菜遗传多样性,以及进化与驯化等方面提供了新的见解;此外,该研究产生的基因组序列和转录组变异数据为促进菠菜研究和育种改良提供了重要资源,可用于培育抗病性更强,产量更高,品质更好的菠菜品种。

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